Это — чума

Молекулы ДНК «чуме », стёршей с лица земли в Средние века треть населения Европы, подняли из могил и секвенировали.

Под именем Yersinia pestis прячется патоген, в свое время стёрший с лица земли треть населения Европы, и еще массу народа в Азии и Африке. Он важен, например, за то, что именуют «чумом » — одну из трех наибольших пандемий чумы, зародившуюся в Монголии и уничтожавшую европейцев во время с 1346 по 1351 год. Спустя практически семь столетий человечество решило разобраться, как ей удалось достигнуть тогда таких ужасных результатов.
Изучать древние патогены принципиально важно для понимания того, какими извилистыми дорогами шагает их эволюция, и каких сюрпризов стоит ожидать от микроскопических неприятелей в будущем. Новейшие технологии секвенирования* и совершенствование способов манипуляции с ДНК разрешили коллективу ученых из Канады, США и Германии реконструировать геном возбудителя европейской эпидемии бубонной чумы XIV века.

Генетический материал удалось взять из останков жертв эпидемии, захороненных в Восточном Смитфилде — районе современного Лондона. Статью о первом секвенированном геноме старой патогенной бактерии разместил в октябре этого года издание Nature.

‹ ›

Изучить старую ДНК непросто. Во-первых, она достаточно нехорошего качества, потому, что деградирует от смены температур, влажности и времени. Приходится иметь дело с фрагментированными и поперечно-сшитыми молекулами. Во-вторых, не всегда легко доказать множеству скептиков, что выделил как раз то, что необходимо. При с Yersinia pestis споров было большое количество.

Сначала некоторыеученые кроме того думали, что в Средние века свирепствовала не чума, а скорее какой-то вариант геморрагической лихорадки типа той, что приводит к вирусу Эбола.

В 2000 году коллектив под управлением Дидье Рауля (Didier Raoult) опубликовал результаты работы, на протяжении которой была выделена ДНК из зубов людей, погребенных в одном из мест массового захоронения жертв эпидемии XIV века. фрагменты и Учёные ДНК при помощи ПЦР и продемонстрировали, что в примерах находятся последовательности генома Yersinia pestis, и, следовательно, в те годы в Европе бушевала как раз чума. Но повторение опыта вторыми авторами под управлением Томаса Гилберта с применением более большой выборки результатов не дало.

Чтобы дотянуться из древних образцов нужную ДНК, употреблялись микрочипы с ДНК сейчас живущих штаммов. Это разрешило исключить из изучения почвенных бактерий и другой генетический мусор. Геном, что оказался в итоге, сравнили с ДНК 17 современных штаммов Yersinia pestis и поняли, что он находится приблизительно в корне эволюционного древа этих последовательностей.

Это указывает, что штамм «чум » имеет большое количество родных родственников среди сейчас циркулирующих чумных палочек.

Авторы изучения уверены в том, что неспециализированный предок секвенированного ими штамма и сейчас живущих возбудителей чумы циркулировал практически за столетие перед тем, как показалась чуми, следовательно, линии чумной палочки, важные за более ранние эпидемии (к примеру, Юстинианова чума 551–580 гг.), бесследно вымерли. Но с этим не согласны многие исследователи, вычисляющие, что команда Пойнара и Краузе не разглядела многие штаммы чумы из восточной Азии, каковые, как полагают, имеют более древних предков.

Анализ генома средневековой Yersinia pestis не распознал радикальных отличий от геномов современных штаммов. Авторы склоняются к тому, что то немыслимое количество жертв, которое унесла чум , связано не столько с изюминками штамма, но в значительной степени, с факторами внешней среды, динамикой распространения через организмов-носителей (кое-какие ученые предполагают, что бубонную чуму XIV столетия переносили не блохи) и повышенной чувствительностью к патогену тогдашнего населения Европы.

Эта статья ,представленая на конкурс научно-популярных работ «био/дескать/текст» biomolecula.ru/content/888 в номинации «Лучшее новостное сообщение», была удостоена поощрительного приза.

Создатель: Юрий Стефанов

Источник: biomolecula.ru

Случайные записи:

• Хамелеоны играют нанокристаллами
• Квантовые эффекты в масштабе вселенной

10фактов о Чуме !!!

Похожие статьи, которые вам понравятся:

• Европейцы произошли от трёх групп населения

  Современное население Европы происходит от трёх древних групп населения, а не от двух, как считалось ранее. К такому выводу пришли исследователи из…

• Молекулы воды контролируют инактивацию и восстановление калиевых каналов

  12 молекул воды снабжают протекание долгого постактивационного восстановительного периода, что нужен калиевым ионным каналам перед тем, как они снова…

• Возможность строительства дерева жизни по микрорнк поставлена под сомнение

  Ещё сравнительно не так давно казалось, что учёные нашли несложной и беспроигрышный метод определения эволюционного родства между группами организмов…

• На движение молекулы могут влиять квантовые процессы

  Не смотря на то, что до тех пор пока такое влияние установлено лишь для одной молекулы, открывшие его учёные считают, что эффект характерен и для многих…