Интересные темы:

Гаджеты

Немного интересного:

На слабые места раковой опухоли могут указать белки-мутанты

09.09.2016 Hi-tech

Русские ученые создали компьютерную программу, находящую «неправильные» протеиновые структуры в живых клетках, способные привести к формированию рака.
Как мы знаем, что точечные замены аминокислотных остатков в белках, каковые происходят по вине мутации ДНК, смогут провоцировать изменение их функций в клетках. Ученые считают, что такие изменения играются важную роль в развитии рака.

Изучение мутантных белков, предпринятое русскими учеными из МФТИ, Университета биомедицинской химии, Университета энергетических неприятностей химической физики РАН и ФНКЦ физико-химической медицины — они разработали метод поиска мутантных белков в живых клетках способом весов-спектрометрического анализа — может оказать помощь выяснить уязвимые места раковых клеток и создать в будущем более действенные лекарственные препараты против онкологических болезней. Результаты работы размещены в издании Proteomics.

Протеогеномика — область, к которой относится новое изучение, сочетает в себе способы геномики и протеомики (науки, изучающей совокупность белков клетки либо целого организма).На слабые места раковой опухоли могут указать белки-мутанты В ней употребляются базы информации о последовательностях аминокислот, видящихся как раз в изучаемых клетках. Способ весов-спектрометрии разрешает выяснить правильный вес молекул белков, их частей и пептидов в имеющихся примерах.

Русские ученые создали метод, что может сравнивать весов-спектрометрические результаты различных исследовательских групп и обнаружить протеиновые мутации, которые связаны с злокачественным процессом. Они протестировали собственную разработку на примере клеточной линии HEK-293, изъятой из почки людской эмбриона. Такая культура довольно часто употребляется в научных изучениях в качестве модели клеток человека, потому, что ее достаточно легко выращивать в лабораториях.

Но также, линия HEK-293 содержит в себе множество мутаций и как раз исходя из этого может служить прекрасной моделью для тестирования протеогеномного подхода к изучению рака.

Для опыта исследователи подготовили расширенную базу данных на базе результатов секвенирования экзома (совокупности участков генов, кодирующих последовательность аминокислот в белке) клеточной линии HEK-293. «Расшифровка» экзома помогла сконцентрировать внимание ученых лишь на протеин-кодирующих генах и распознать размещение экзонов в них. База изучения возросла в итоге на 1336 вариантов последовательностей.

Иными словами, в протеиновый «словарь» добавились последовательности, каковые отличаются от исходных всего лишь на одну либо пара аминокислот. Без таковой подробной базы поисковая программа не имела возможности бы действенно обнаружить частично «неправильные» белки.

Как мы знаем, что в каждой живой клетке всегда происходят мутации, а в злокачественных клетках — особенно довольно часто. Так, обнаружение белков, отличающихся от «верных», окажет помощь ученым осознать, чем раковая клетка отличается от обычной.

«Отечественный подход может в будущем употребляться для поиска ассоциированных с раком мутаций на базе протеомных данных. Это, со своей стороны, окажет помощь в изучении протеинового состава опухолей и разработке препаратов, “нацеленных” на мутантные белки, создаваемые в опухолевых клетках», — сообщил заведующий лабораторией физико-химических способов изучения структуры веществ ИНЭПХФ РАН Михаил Горшков, один из авторов работы.

Случайные записи:

Провели операцию по удалению опухоли мозга


Похожие статьи, которые вам понравятся:

Tags:  , , ,