Социологи и генетики объединились в борьбе с туберкулёзом

Канадские учёные предложили новый стандарт исследования и прогнозирования вспышек инфекционных болезней. Они объединили эти сравнительной геномики патогенов с детальным картированием социальных взаимоотношений. Возможности стандарта изучены на примере недавней вспышки туберкулёза в Английской Колумбии (Канада).

Выводы опубликованы 24 февраля в издании New England Journal of Medicine.

В изучение был включён 41 больной с клиническими проявлениями туберкулёза. Опрос испытуемых продемонстрировал, что они принадлежат к одному социальному кругу и большая часть больных привычны между собой.

Учёные попытались совершить молекулярный фингерпринтинг ДНК бактерий, взятых от участников изучения. Данный способ, анализ «отпечатков пальцев» – вариабельных участков генома, в большинстве случаев разрешает выяснить, как происходило расселение бактерий. В этом случае, но, первая попытка была неудачной: так как заражение случилось сравнительно не так давно, бактерии от различных больных были через чур похожи приятель на приятеля.

Тогда эксперты Контрольного центра болезней Английской Колумбии, Канадского центра геномных Университета и исследований Симона Фрэзера решили совершить полное секвенирование геномов для обнаружения узких генетических различий между бактериальными штаммами. Эти маленькие различия разрешили учёным идентифицировать отдельные события передачи заразы, в которых один из больных определялся как самый вероятный источник заражения другого. Разглядев все события передачи заразы, авторы смогли выяснить, где появилась вспышка туберкулёза и как патоген распространился по сообществу.

Изучение продемонстрировало, что туберкулёз передавался не по цепи (один человек передаёт другого, тот – третьего, и т.д.), а был результатом вспышек заражения, при которых отдельные личности передавали многих контактёров. Помимо этого, стало известно, что нужным условием вспышки распространения того либо иного штамма патогена есть постоянное наличие и членов тесное общение сообщества определённых негативных социальных факторов, таких как потребление крэка и кокаина больными, обследованными в данной работе.

«Секвенирование полного генома до недавнего времени стоило дорого, что делало анализ бактериальных геномов у всех больных, участвующих во вспышке, попросту неосуществимым. Исходя из этого мы вынуждены были применять ДНК-фингерпринтинг, – цитирует одного из авторов работы, Дженифер Гарди (Jennifer Gardy), портал EurekAlert. – Сейчас же секвенирование десятков, сотен либо тысяч бактериальных изолятов в полной мере выполнимо в разумные сроки и по разумной цене.

Мы можем осознать родственные связи этих бактерий между собой, сравнивая их геномные последовательности. После этого мы можем наложить эти сведенья на карту социальных связей заразившихся больных и реконструировать путь, которым инфекционный агент распространялся в популяции».

Познание механизмов распространения возбудителей заразы имеет главное значение для здравоохранения, поскольку разрешает предвещать и предотвращать подобные эпидемии в будущем.

Источник информации:

Gardy J.L. et al. Whole-Genome Sequencing and Social-Network Analysis of a Tuberculosis Outbreak. – N Engl J Med 2011; 364:730–739 February 24, 2011.

Разведопрос: Александр Панчин о гомеопатии

Похожие статьи, которые вам понравятся:

• Могут ли бактерии вылечить от рака?

  Бактерии смогут вынудить злокачественную опухоль отойти, но для этого необходимо выбрать верный вид микроорганизмов. Это может показаться необычным, но…

• Гены расскажут о том, кто ваши друзья

  Вы имеете возможность иметь намного больше неспециализированного с вашими приятелями, чем легко любовь и чувство юмора к одним и тем же заведениям….

• Социальный статус влияет на иммунитет?

  Новое изучение, в котором участвовали макаки-резусы, быть может, помогло отыскать ответ на вопрос, что в далеком прошлом стоял перед учеными. Была…