Создана мировая карта устойчивости к антибиотикам

23.11.2015 Hi-tech

Русские ученые создали интерактивную мировую карту резистентности микробиоты кишечника к антибиотикам — ResistoMap. Она окажет помощь распознать национальные изюминки в потреблении антибиотиков и осуществлять контроль лекарственную устойчивость в глобальном масштабе. Разработка картографирования представлена в издании Bioinformatics, а сам ресурс дешёв по адресу http://resistomap.rcpcm.org/.

Микробная лекарственная устойчивость позвана широким неконтролируемым применением антибиотиков в сельском хозяйстве и медицине. Прогнозируется, что к 2050 году около десяти миллионов человек будет умирать каждый год из-за обстоятельств, которые связаны с лекарственной устойчивостью.

Русские ученые из Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины, Столичного физтех института и Лаборатории данных создали интерактивную визуализацию кишечного резистома — присутствия генов лекарственной устойчивости к действию антибиотиков в микробиоте кишечника человека. Навигационный слой географической карты разрешает сформулировать догадки довольно глобальных тенденций устойчивости к антибиотикам и сопоставить особенности резистома кишечника с национальными практиками по применению лекарств.

Создана мировая карта устойчивости к антибиотикам

Пул генов антибиотикорезистентности (дающих бактериям устойчивость к действию препарата), уровень которого возрастает на протяжении лечения антибиотиками, возможно есть «коромыслом» в передаче этих генов патогену. Анализ функционального состава микробиоты с применением метагеномики разрешает оценить распространенность генов устойчивости в микробиоте человека и, так, в возможности обеспечить личный прогноз для свойства микробиоты человека внести вклад в устойчивость патогенов. К настоящему моменту опубликованы широкие количества метагеномных данных по микробиоте кишечника, каковые позволяют оценить разброс структуры резистома у здорового населения государств, и у больных с разными болезнями.

ResistoMap содержит два главных интерактивных рабочих поля: географическую и тепловую карты. Пользователь может выбрать интересующую группу антибиотиков либо страну, которая будет отображаться в тепловой карте, и взять срез резистома. Эти смогут быть отфильтрованы по государствам, полу, диагнозу и возрасту.

На данный момент разработчиками проанализированы на предмет уровня резистома эти для более чем 1600 человек из 12 изучений, охватывающих 15 государств, наряду с этим для пользователей ресурса имеется возможность добавления на карту резистома новых опубликованных данных в едином формате.

Применяя ResistoMap, возможно оценить глобальное изменение потенциала резистентности к разным группам антибиотиков. К примеру, метагеномы датчан, в большинстве случаев, демонстрируют самый низкий уровень резистома среди европейских групп, в то время как французские образцы имеют самые большие уровни, в особенности фторхинолонов — бактерицидных лекарственных средств многих действия. Это согласуется с тем фактом, что Франция имеет самый большой неспециализированный уровень применения антибиотиков в Западной Европе, а Германия и Дания — страны, где использование противомикробных препаратов умеренно как в здравоохранении, так и в сельском хозяйстве.

Иначе, китайское и русское население имеет более большой уровень резистома, возможно, ввиду менее твёрдых правил применения антибиотиков, нередкого назначения антибиотиков многих, и легкой доступности антибиотиков без рецепта. Самые низкие уровни резистентности микробиоты наблюдаются у изолированной популяции индейцев из Венесуэлы, фактически не имеющих контактов с населением развитых государств.

Случайные записи:

Эволюция бактерий в огромной чашке Петри


Похожие статьи, которые вам понравятся: